במחלקות הפנימיות מאושפזים חולים הסובלים ממגוון מחלות פנימיות, כגון מחלות לב, ריאה, דרכי העיכול, מחלות מערכת העצבים המרכזית, מחלות אונקולוגיות והמטואונקולוגיות, מחלות זיהומיות שונות, ומחלות השכיחות באוכלוסיה המבוגרת. מטרת האשפוז היא אבחון המצב הרפואי, מתן טיפול ייעודי, איזון מצב החולה והחזרתו למצב יציב. חלק מהחולים נזקקים לפעולות אבחוניות שונות במהלך אשפוזם, חלקן פולשניות כגון צנתור כלילי (צנתור עורקי הלב) וחלקן לא פולשניות כולל בדיקות טומוגרפיה מחשבית (CT) ובדיקות על־שמע (אולטרסאונד) שונות.
לאחרונה הוקמה חטיבה פנימית, המאגדת בתוכה 5 מחלקות פנימיות, מחלקה גריאטרית ואת מכוני הלב, מכון מחלות דרכי העיכול והכבד, מכון הכליות, המכון ההמטולוגי, המכון למחלות זיהומיות והמכון האונקולוגי.
השינוי והדינמיות לא פסחו על המחלקות הפנימיות שעברו ריענון והצערת הצוות הבכיר לאחרונה. בכל מחלקה המנהל הנו בעל התמחות נוספת פרט לרפואה פנימית, וכך הדבר גם עם מירב הרופאים הבכירים.
פנימית א'
מנהל מחלקה ד"ר יעקב קוגן
ד"ר קוגן כיהן כסגן מנהל מחלקה בשנת 2001 ומנהל מחלקה פנימית א' משנת 2014. ד"ר קוגן ניהל מרפאת סוכרת בבית חולים ברזילי וקופת חולים לאומית. ד"ר קוגן משמש גם כמרצה באוניברסיטת בן גוריון מ2008.
פנימית ב'
ד"ר משעל
מנהל מחלקה ד"ר יוסף משעל
ד"ר משעל בעל תואר דוקטור לרפואה MD, מהפקולטה לרפואה בעיר Padova באיטליה. ד"ר משעל חבר בוועדת הלסינקי ובוועדת התרופות בברזילי. כמו כן ד"ר משעל משמש כמרצה בפקולטה למדעי הבריאות באוניברסיטת בן גוריון.
פנימית ג'
פרופ' מגן
מנהל מחלקה פרופ' אלי מגן
פרופ' מגן סיים לימודי רפואה M.D בהצטיינות יתרה, באוניברסיטת קרים, ברית המועצות. פרופ' מגן משמש כמרצה בכיר במחלקה לרפואה, הפקולטה למדעי בריאות, אוניברסיטת בן גוריון בנגב. לאחרונה מונה לתפקיד מנהל המערך לאלרגיה, אימונולוגיה ואנגיואדמה בבית החולים.
פנימית ד'
פרופ' זמיר
מנהל מחלקה פרופ' דורון זמיר
פרופ' זמיר הוא יושב ראש החטיבה הפנימית, מרכז רפואי ברזילי. מרצה ומדריך סטודנטים באוניברסיטת בן גוריון כ 17 שנה.בנוסף פרופ' זמיר חבר ועדת הביקורת של איגוד הגסטרואנטרולוגיה והועדה למקצועות הפנימיים במועצה המדעית. חבר לשעבר של ועד האיגוד לרפואה פנימית. ד"ר דורון זמיר מחבר ראשי ושותף ל 78 מאמרים בספרות מקצועית.
גריאטריה
מנהלת מחלקה ד"ר זהבה גליק
ד"ר גליק
ד"ר גליק מנהלת מח' גריאטרית במרכז הרפואי ברזילי, משנת 1991. ד"ר גליק מחברת שאלות לבחינות שלב א' וב' בגריאטריה ובקרית במוסדות גריאטריה .בעברה היתה יו"ר ועדת היגוי לקשישים בסיכון,ו"ר ועדה על ארגונית שמתקיימת בלשכת הרווחה הדנה בנושא קשישים בסיכון ויו"ר מרכז מידע לקשיש ולמשפחתו במרכז הרפואי ברזילי. לד"ר זהבה גליק מחקרים ופרסומים רבים בעיתונות הרפואית הבין־לאומית.
