במשך עשרות שנים שימש מבנה זמני במושב כוכב מיכאל כבית כנסת לטובת ציבור המתפללים תושבי המושב. בשנים האחרונות התגבשה במושב החלטה להקים מבנה ראוי ומכובד עוד יותר כדי שישמש בית כנסת. לאחר תהליך, של תכנון המבנה על פי הצרכים של המתפללים ולאחר איתור שטח וקבלת כל האישורים בתכנוניים התקיים לפני שנה, באוקטובר 2016, טקס הנחת אבן הפינה לבניית מבנה קבע במעמד ראש המועצה יאיר פרג'ון, האחראי על שירותי הדת במועצה מאיר ירימי, רב המועצה יעקב אביטן ויו"ר הוועד אמנון ברזין.
ביום רביעי האחרון, יומיים לפני היכנס היום הנכבד והקדוש ביותר, יום הכיפורים, נחנך במעמד מרגש ובשעה טובה מבנה הקבע של בית הכנסת. המתפללים נשאו את ספרי התורה מבית הכנסת הישן, מרחק של כ-100 מטרים למשכנם החדש בליווי שירים וריקודים.
מבנה בית הכנסת משתרע על פני 150 מ"ר וכולל כיסאות חדשים, ממ"ד, מטבחון ונגישות לנכים. כמו כן בוצעו עבודות פיתוח סביבתי כולל מדשאה ותאורה.
"אני נרגש להיות כאן היום. כשביקשו להקים בית כנסת בכוכב מיכאל, ראיתי את הנחישות של הקהילה והתחלנו להתארגן. פנינו למשרד הדתות וקיבלנו תקציב מכובד, בנוסף למועצה. אגודת המושב הקצתה את הקרקע והביצוע היה של החברה הכלכלית שלנו. אני מודה לשר אזולאי".
השר לשירותי דת, ח"כ אזולאי, אמר: "הגעתי היום לכבד את המקום והאנשים, למרות העומס בלוח הזמנים. בעוד פחות מ-48 שעות כולנו נעמוד בבית הכנסת, רגע לפני החתימה הגדולה ואתם תתפללו בבית הכנסת הזה, החדש והמפואר, ביום הכיפורים".
"אני שמח שהגענו לרגע הזה ובית הכנסת יכיל את מי שיבוא, באהבה" אמר נרגש יו"ר ועד המושב אמנון ברזין "המושב שלנו אמנם חילוני, אבל מה שיפה הוא שכמעט כולם היו שותפים להקמת בית הכנסת, מי בגלוי ומי בסתר ולהביא לפתיחתו רגע לפני יום כיפור. וזה יפה ומאחד את המושב".